設定を開きます。

jsonのprofilesに以下のような設定があります。
{ "guid": "{3092b9ac-06b9-5c04-a123-3f7b1c90c758}", "hidden": false, "name": "develop", "source": "Windows.Terminal.Wsl" }
ここに startingDirectory を設定してあげれば良いのですが、これはWindows側から見たディレクトリを設定しなければなりません。
そのため、以下のように //wsl$/経由で指定します。
{
"guid": "{3092b9ac-06b9-5c04-a123-3f7b1c90c758}",
"hidden": false,
"name": "develop",
"startingDirectory": "//wsl$/{DistributionName}/home/{UserName}",
"source": "Windows.Terminal.Wsl"
}